Если при попытке установки чего-либо из репо, используя yum, выдается такая ошибка:

yum install sysstat
error: rpmdb: BDB0113 Thread/process 9564/140268107065152 failed: BDB1507 Thread died in Berkeley DB library
error: db5 error(-30973) from dbenv->failchk: BDB0087 DB_RUNRECOVERY: Fatal error, run database recovery
error: cannot open Packages index using db5 -  (-30973)
error: cannot open Packages database in /var/lib/rpm
CRITICAL:yum.main:

Error: rpmdb open failed

То чинится это дело ребилдом базы yum.

mv /var/lib/rpm/__db* /tmp/ - сохраняем базу на всякий случай
rpm --rebuilddb
yum clean all
Loaded plugins: fastestmirror
Cleaning repos: base epel extras updates
Cleaning up everything
Cleaning up list of fastest mirrors